Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM4P67936 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM4P67936 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM4P67936 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPM4P67936 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM4P67936 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM4P67936 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM4P67936 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM4P67936 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM4P67936 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM4P67936 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM4P67936 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM4P67936 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM4P67936 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM4P67936 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM4P67936 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM4P67936 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM4P67936 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM4P67936 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM4P67936 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM4P67936 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM4P67936 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM4P67936 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM4P67936 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM4P67936 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM4P67936 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM4P67936 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPM4P67936 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM4P67936 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM4P67936 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM4P67936 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM4P67936 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM4P67936 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM4P67936 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM4P67936 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM4P67936 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM4P67936 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM4P67936 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM4P67936 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM4P67936 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM4P67936 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM4P67936 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM4P67936 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM4P67936 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM4P67936 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM4P67936 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM4P67936 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM4P67936 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM4P67936 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM4P67936 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM4P67936 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM4P67936 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM4P67936 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM4P67936 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPM4P67936 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM4P67936 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM4P67936 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM4P67936 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM4P67936 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM4P67936 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM4P67936 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM4P67936 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM4P67936 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM4P67936 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM4P67936 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM4P67936 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM4P67936 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPM4P67936 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPM4P67936 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPM4P67936 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPM4P67936 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPM4P67936 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPM4P67936 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPM4P67936 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM4P67936 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM4P67936 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM4P67936 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM4P67936 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM4P67936 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM4P67936 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM4P67936 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM4P67936 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM4P67936 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM4P67936 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM4P67936 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM4P67936 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM4P67936 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM4P67936 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM4P67936 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM4P67936 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM4P67936 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM4P67936 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM4P67936 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM4P67936 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM4P67936 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM4P67936 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM4P67936 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPM4P67936 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM4P67936 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM4P67936 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms