Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P61574 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms