Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS3AP61247 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS3AP61247 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms