Protein–RNA interactions for Protein: P60827

C1QTNF8, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF8P60827 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C1QTNF8P60827 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1QTNF8P60827 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms