Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DEFA1P59665 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA1P59665 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms