Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHBDL3P58872 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDL3P58872 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms