Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE6CP51160 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE6CP51160 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE6CP51160 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE6CP51160 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE6CP51160 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE6CP51160 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE6CP51160 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE6CP51160 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDE6CP51160 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDE6CP51160 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE6CP51160 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE6CP51160 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6CP51160 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6CP51160 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6CP51160 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6CP51160 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6CP51160 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6CP51160 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6CP51160 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6CP51160 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6CP51160 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6CP51160 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6CP51160 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6CP51160 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6CP51160 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6CP51160 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6CP51160 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDE6CP51160 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6CP51160 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6CP51160 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6CP51160 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6CP51160 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6CP51160 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6CP51160 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6CP51160 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6CP51160 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE6CP51160 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE6CP51160 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE6CP51160 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE6CP51160 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE6CP51160 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE6CP51160 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE6CP51160 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE6CP51160 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDE6CP51160 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE6CP51160 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE6CP51160 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE6CP51160 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE6CP51160 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE6CP51160 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE6CP51160 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE6CP51160 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE6CP51160 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE6CP51160 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE6CP51160 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE6CP51160 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE6CP51160 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE6CP51160 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE6CP51160 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE6CP51160 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE6CP51160 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE6CP51160 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE6CP51160 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE6CP51160 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE6CP51160 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE6CP51160 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE6CP51160 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE6CP51160 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE6CP51160 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms