Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERFP50548 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERFP50548 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERFP50548 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ERFP50548 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERFP50548 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERFP50548 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERFP50548 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERFP50548 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERFP50548 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERFP50548 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERFP50548 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ERFP50548 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERFP50548 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERFP50548 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERFP50548 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERFP50548 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERFP50548 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERFP50548 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERFP50548 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERFP50548 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERFP50548 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERFP50548 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERFP50548 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERFP50548 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERFP50548 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERFP50548 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERFP50548 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERFP50548 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERFP50548 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERFP50548 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERFP50548 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERFP50548 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERFP50548 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERFP50548 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERFP50548 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ERFP50548 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERFP50548 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERFP50548 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERFP50548 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERFP50548 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERFP50548 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERFP50548 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERFP50548 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERFP50548 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERFP50548 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERFP50548 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERFP50548 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERFP50548 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERFP50548 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERFP50548 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERFP50548 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERFP50548 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERFP50548 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERFP50548 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERFP50548 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERFP50548 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERFP50548 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERFP50548 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ERFP50548 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERFP50548 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERFP50548 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERFP50548 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERFP50548 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERFP50548 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERFP50548 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERFP50548 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERFP50548 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERFP50548 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERFP50548 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERFP50548 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms