Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM4SF4P48230 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms