Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5OP48047 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms