Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAD52P43351 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAD52P43351 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAD52P43351 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAD52P43351 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAD52P43351 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
RAD52P43351 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAD52P43351 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAD52P43351 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAD52P43351 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAD52P43351 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD52P43351 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD52P43351 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD52P43351 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD52P43351 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD52P43351 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD52P43351 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD52P43351 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD52P43351 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD52P43351 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD52P43351 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD52P43351 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD52P43351 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD52P43351 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD52P43351 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD52P43351 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD52P43351 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD52P43351 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD52P43351 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD52P43351 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD52P43351 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD52P43351 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD52P43351 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD52P43351 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD52P43351 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD52P43351 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD52P43351 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD52P43351 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD52P43351 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD52P43351 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD52P43351 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD52P43351 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD52P43351 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD52P43351 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms