Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA2P42262 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIA2P42262 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms