Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms