Protein–RNA interactions for Protein: P38398

BRCA1, Breast cancer type 1 susceptibility protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA1P38398 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRCA1P38398 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRCA1P38398 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRCA1P38398 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRCA1P38398 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRCA1P38398 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRCA1P38398 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms