Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM5P33992 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM5P33992 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM5P33992 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM5P33992 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM5P33992 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM5P33992 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM5P33992 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM5P33992 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM5P33992 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM5P33992 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM5P33992 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM5P33992 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM5P33992 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM5P33992 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM5P33992 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM5P33992 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM5P33992 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM5P33992 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM5P33992 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM5P33992 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM5P33992 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM5P33992 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM5P33992 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM5P33992 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM5P33992 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM5P33992 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM5P33992 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM5P33992 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM5P33992 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM5P33992 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM5P33992 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM5P33992 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM5P33992 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM5P33992 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM5P33992 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM5P33992 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM5P33992 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM5P33992 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCM5P33992 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCM5P33992 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCM5P33992 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM5P33992 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM5P33992 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM5P33992 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM5P33992 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM5P33992 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM5P33992 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM5P33992 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM5P33992 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM5P33992 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM5P33992 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM5P33992 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM5P33992 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM5P33992 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM5P33992 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM5P33992 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM5P33992 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM5P33992 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM5P33992 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM5P33992 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM5P33992 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM5P33992 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM5P33992 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM5P33992 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM5P33992 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM5P33992 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM5P33992 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM5P33992 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM5P33992 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM5P33992 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM5P33992 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM5P33992 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM5P33992 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM5P33992 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM5P33992 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM5P33992 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM5P33992 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM5P33992 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM5P33992 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM5P33992 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM5P33992 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM5P33992 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM5P33992 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM5P33992 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM5P33992 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM5P33992 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM5P33992 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM5P33992 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM5P33992 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM5P33992 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM5P33992 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM5P33992 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM5P33992 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM5P33992 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM5P33992 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM5P33992 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM5P33992 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM5P33992 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM5P33992 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms