Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP1P32455 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP1P32455 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP1P32455 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP1P32455 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP1P32455 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP1P32455 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP1P32455 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP1P32455 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP1P32455 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP1P32455 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP1P32455 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBP1P32455 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GBP1P32455 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GBP1P32455 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GBP1P32455 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GBP1P32455 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GBP1P32455 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GBP1P32455 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP1P32455 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP1P32455 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP1P32455 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP1P32455 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP1P32455 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP1P32455 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP1P32455 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP1P32455 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP1P32455 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP1P32455 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP1P32455 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP1P32455 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP1P32455 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP1P32455 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP1P32455 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP1P32455 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP1P32455 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP1P32455 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP1P32455 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP1P32455 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBP1P32455 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP1P32455 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP1P32455 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP1P32455 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP1P32455 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP1P32455 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP1P32455 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP1P32455 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP1P32455 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP1P32455 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP1P32455 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP1P32455 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP1P32455 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP1P32455 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP1P32455 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP1P32455 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP1P32455 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBP1P32455 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBP1P32455 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBP1P32455 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBP1P32455 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBP1P32455 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBP1P32455 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBP1P32455 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBP1P32455 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBP1P32455 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBP1P32455 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBP1P32455 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBP1P32455 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBP1P32455 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBP1P32455 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GBP1P32455 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBP1P32455 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBP1P32455 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBP1P32455 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBP1P32455 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBP1P32455 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBP1P32455 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBP1P32455 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBP1P32455 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBP1P32455 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBP1P32455 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBP1P32455 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBP1P32455 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBP1P32455 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBP1P32455 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBP1P32455 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBP1P32455 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBP1P32455 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBP1P32455 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBP1P32455 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBP1P32455 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBP1P32455 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBP1P32455 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBP1P32455 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBP1P32455 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GBP1P32455 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBP1P32455 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBP1P32455 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBP1P32455 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBP1P32455 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms