Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKARP32238 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKARP32238 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKARP32238 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKARP32238 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKARP32238 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKARP32238 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKARP32238 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCKARP32238 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCKARP32238 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCKARP32238 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCKARP32238 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CCKARP32238 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCKARP32238 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCKARP32238 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCKARP32238 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCKARP32238 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCKARP32238 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCKARP32238 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCKARP32238 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCKARP32238 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCKARP32238 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCKARP32238 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCKARP32238 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCKARP32238 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCKARP32238 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCKARP32238 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCKARP32238 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCKARP32238 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCKARP32238 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCKARP32238 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCKARP32238 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCKARP32238 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCKARP32238 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCKARP32238 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCKARP32238 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCKARP32238 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms