Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms