Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPOP30536 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPOP30536 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPOP30536 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPOP30536 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPOP30536 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPOP30536 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPOP30536 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPOP30536 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPOP30536 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPOP30536 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPOP30536 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPOP30536 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPOP30536 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPOP30536 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPOP30536 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPOP30536 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPOP30536 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPOP30536 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPOP30536 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSPOP30536 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSPOP30536 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSPOP30536 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSPOP30536 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPOP30536 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPOP30536 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPOP30536 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPOP30536 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPOP30536 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPOP30536 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSPOP30536 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPOP30536 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPOP30536 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPOP30536 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPOP30536 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPOP30536 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSPOP30536 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPOP30536 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPOP30536 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPOP30536 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPOP30536 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPOP30536 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPOP30536 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPOP30536 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPOP30536 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPOP30536 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPOP30536 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPOP30536 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPOP30536 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPOP30536 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms