Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms