Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5DP30049 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms