Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCD3P28288 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms