Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTSSP25774 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTSSP25774 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTSSP25774 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTSSP25774 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTSSP25774 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTSSP25774 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTSSP25774 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTSSP25774 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTSSP25774 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTSSP25774 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTSSP25774 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTSSP25774 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTSSP25774 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTSSP25774 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTSSP25774 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTSSP25774 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTSSP25774 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTSSP25774 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTSSP25774 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTSSP25774 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTSSP25774 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTSSP25774 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTSSP25774 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTSSP25774 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTSSP25774 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTSSP25774 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTSSP25774 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTSSP25774 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTSSP25774 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTSSP25774 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTSSP25774 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTSSP25774 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTSSP25774 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTSSP25774 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTSSP25774 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTSSP25774 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTSSP25774 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTSSP25774 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTSSP25774 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTSSP25774 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTSSP25774 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms