Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRZ1P23471 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms