Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NF1P21359 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NF1P21359 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NF1P21359 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NF1P21359 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NF1P21359 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NF1P21359 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NF1P21359 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NF1P21359 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NF1P21359 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NF1P21359 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NF1P21359 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NF1P21359 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NF1P21359 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NF1P21359 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NF1P21359 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NF1P21359 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NF1P21359 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NF1P21359 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NF1P21359 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NF1P21359 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NF1P21359 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NF1P21359 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NF1P21359 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NF1P21359 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NF1P21359 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NF1P21359 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NF1P21359 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NF1P21359 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NF1P21359 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NF1P21359 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NF1P21359 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NF1P21359 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NF1P21359 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NF1P21359 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NF1P21359 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NF1P21359 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NF1P21359 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NF1P21359 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NF1P21359 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NF1P21359 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NF1P21359 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NF1P21359 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NF1P21359 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NF1P21359 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NF1P21359 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NF1P21359 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NF1P21359 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NF1P21359 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NF1P21359 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NF1P21359 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NF1P21359 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NF1P21359 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NF1P21359 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NF1P21359 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NF1P21359 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NF1P21359 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NF1P21359 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NF1P21359 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NF1P21359 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NF1P21359 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NF1P21359 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NF1P21359 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NF1P21359 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NF1P21359 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NF1P21359 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NF1P21359 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NF1P21359 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NF1P21359 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NF1P21359 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NF1P21359 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NF1P21359 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NF1P21359 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NF1P21359 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NF1P21359 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NF1P21359 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NF1P21359 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NF1P21359 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NF1P21359 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NF1P21359 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NF1P21359 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NF1P21359 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NF1P21359 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NF1P21359 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NF1P21359 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NF1P21359 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NF1P21359 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NF1P21359 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NF1P21359 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NF1P21359 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NF1P21359 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NF1P21359 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NF1P21359 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NF1P21359 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NF1P21359 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NF1P21359 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NF1P21359 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NF1P21359 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NF1P21359 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NF1P21359 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms