Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms