Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD33P20138 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD33P20138 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD33P20138 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD33P20138 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD33P20138 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD33P20138 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD33P20138 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD33P20138 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD33P20138 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD33P20138 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD33P20138 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD33P20138 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms