Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF3P18847 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF3P18847 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF3P18847 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF3P18847 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF3P18847 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF3P18847 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ATF3P18847 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ATF3P18847 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATF3P18847 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATF3P18847 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATF3P18847 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATF3P18847 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATF3P18847 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATF3P18847 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATF3P18847 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATF3P18847 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ATF3P18847 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATF3P18847 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATF3P18847 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF3P18847 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF3P18847 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF3P18847 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF3P18847 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF3P18847 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF3P18847 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF3P18847 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF3P18847 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF3P18847 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF3P18847 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF3P18847 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF3P18847 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF3P18847 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF3P18847 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF3P18847 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF3P18847 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF3P18847 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF3P18847 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF3P18847 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF3P18847 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF3P18847 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF3P18847 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF3P18847 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF3P18847 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF3P18847 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF3P18847 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF3P18847 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF3P18847 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF3P18847 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF3P18847 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF3P18847 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF3P18847 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF3P18847 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF3P18847 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF3P18847 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF3P18847 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF3P18847 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF3P18847 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF3P18847 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATF3P18847 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATF3P18847 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATF3P18847 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATF3P18847 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATF3P18847 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATF3P18847 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATF3P18847 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF3P18847 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF3P18847 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF3P18847 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF3P18847 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF3P18847 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF3P18847 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF3P18847 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF3P18847 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF3P18847 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF3P18847 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF3P18847 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF3P18847 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF3P18847 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF3P18847 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF3P18847 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF3P18847 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF3P18847 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATF3P18847 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATF3P18847 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATF3P18847 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATF3P18847 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATF3P18847 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATF3P18847 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATF3P18847 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATF3P18847 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATF3P18847 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATF3P18847 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATF3P18847 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ATF3P18847 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATF3P18847 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATF3P18847 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATF3P18847 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF3P18847 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF3P18847 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms