Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACADSP16219 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSP16219 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSP16219 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSP16219 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSP16219 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSP16219 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSP16219 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSP16219 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSP16219 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSP16219 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSP16219 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSP16219 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSP16219 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSP16219 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSP16219 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSP16219 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSP16219 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSP16219 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSP16219 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSP16219 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSP16219 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSP16219 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSP16219 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSP16219 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSP16219 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSP16219 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSP16219 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSP16219 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSP16219 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSP16219 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSP16219 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSP16219 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSP16219 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSP16219 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSP16219 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSP16219 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSP16219 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSP16219 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSP16219 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSP16219 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSP16219 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSP16219 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSP16219 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSP16219 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSP16219 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSP16219 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSP16219 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSP16219 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSP16219 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSP16219 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms