Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL5P13501 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL5P13501 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL5P13501 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL5P13501 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL5P13501 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL5P13501 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL5P13501 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL5P13501 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL5P13501 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL5P13501 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL5P13501 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL5P13501 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL5P13501 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL5P13501 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL5P13501 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL5P13501 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL5P13501 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL5P13501 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL5P13501 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL5P13501 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL5P13501 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL5P13501 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL5P13501 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL5P13501 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL5P13501 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL5P13501 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL5P13501 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL5P13501 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL5P13501 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL5P13501 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL5P13501 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL5P13501 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL5P13501 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL5P13501 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL5P13501 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL5P13501 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL5P13501 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL5P13501 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL5P13501 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL5P13501 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL5P13501 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL5P13501 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL5P13501 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL5P13501 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL5P13501 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL5P13501 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL5P13501 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL5P13501 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL5P13501 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL5P13501 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL5P13501 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL5P13501 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL5P13501 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL5P13501 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL5P13501 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL5P13501 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL5P13501 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL5P13501 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL5P13501 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL5P13501 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL5P13501 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL5P13501 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL5P13501 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL5P13501 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL5P13501 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL5P13501 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL5P13501 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL5P13501 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL5P13501 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL5P13501 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL5P13501 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL5P13501 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL5P13501 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL5P13501 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL5P13501 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL5P13501 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL5P13501 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL5P13501 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL5P13501 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL5P13501 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCL5P13501 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL5P13501 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL5P13501 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL5P13501 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL5P13501 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL5P13501 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL5P13501 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL5P13501 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL5P13501 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL5P13501 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL5P13501 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL5P13501 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL5P13501 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL5P13501 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL5P13501 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL5P13501 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL5P13501 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL5P13501 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL5P13501 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms