Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms