Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3P10147 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3P10147 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3P10147 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3P10147 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3P10147 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3P10147 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3P10147 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3P10147 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3P10147 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3P10147 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3P10147 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3P10147 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3P10147 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3P10147 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3P10147 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3P10147 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3P10147 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3P10147 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3P10147 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3P10147 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3P10147 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3P10147 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3P10147 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3P10147 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3P10147 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3P10147 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3P10147 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3P10147 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3P10147 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3P10147 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3P10147 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3P10147 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3P10147 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3P10147 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3P10147 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3P10147 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3P10147 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3P10147 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3P10147 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL3P10147 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL3P10147 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL3P10147 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL3P10147 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL3P10147 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL3P10147 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL3P10147 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3P10147 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3P10147 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3P10147 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3P10147 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3P10147 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3P10147 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3P10147 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3P10147 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3P10147 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3P10147 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3P10147 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3P10147 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3P10147 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3P10147 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3P10147 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3P10147 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3P10147 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3P10147 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3P10147 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3P10147 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3P10147 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3P10147 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3P10147 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3P10147 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3P10147 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL3P10147 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3P10147 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3P10147 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3P10147 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3P10147 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3P10147 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3P10147 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3P10147 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3P10147 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3P10147 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3P10147 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3P10147 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3P10147 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3P10147 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3P10147 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3P10147 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3P10147 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3P10147 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3P10147 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3P10147 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3P10147 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3P10147 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3P10147 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3P10147 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3P10147 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3P10147 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3P10147 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL3P10147 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms