Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV1-8P0DP01 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms