Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms