Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms