Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXB5P09067 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB5P09067 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms