Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTMAP06454 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTMAP06454 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTMAP06454 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTMAP06454 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTMAP06454 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTMAP06454 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTMAP06454 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTMAP06454 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTMAP06454 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTMAP06454 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTMAP06454 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTMAP06454 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTMAP06454 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTMAP06454 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTMAP06454 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTMAP06454 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTMAP06454 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTMAP06454 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTMAP06454 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTMAP06454 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTMAP06454 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTMAP06454 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTMAP06454 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTMAP06454 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTMAP06454 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTMAP06454 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTMAP06454 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTMAP06454 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTMAP06454 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTMAP06454 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTMAP06454 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTMAP06454 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTMAP06454 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTMAP06454 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTMAP06454 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTMAP06454 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTMAP06454 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTMAP06454 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTMAP06454 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTMAP06454 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTMAP06454 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTMAP06454 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTMAP06454 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTMAP06454 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTMAP06454 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTMAP06454 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTMAP06454 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTMAP06454 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTMAP06454 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTMAP06454 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTMAP06454 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTMAP06454 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTMAP06454 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTMAP06454 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTMAP06454 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTMAP06454 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTMAP06454 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTMAP06454 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTMAP06454 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTMAP06454 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTMAP06454 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTMAP06454 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTMAP06454 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTMAP06454 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTMAP06454 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTMAP06454 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTMAP06454 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms