Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA1P02647 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA1P02647 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA1P02647 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA1P02647 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA1P02647 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA1P02647 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA1P02647 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA1P02647 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA1P02647 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA1P02647 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA1P02647 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA1P02647 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA1P02647 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA1P02647 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA1P02647 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA1P02647 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA1P02647 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA1P02647 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA1P02647 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA1P02647 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA1P02647 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA1P02647 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA1P02647 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA1P02647 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA1P02647 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA1P02647 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA1P02647 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA1P02647 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA1P02647 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA1P02647 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA1P02647 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA1P02647 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA1P02647 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA1P02647 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA1P02647 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA1P02647 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA1P02647 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOA1P02647 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOA1P02647 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOA1P02647 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOA1P02647 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOA1P02647 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOA1P02647 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOA1P02647 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOA1P02647 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOA1P02647 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOA1P02647 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOA1P02647 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
APOA1P02647 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOA1P02647 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA1P02647 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA1P02647 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA1P02647 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA1P02647 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA1P02647 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA1P02647 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA1P02647 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA1P02647 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA1P02647 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA1P02647 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA1P02647 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA1P02647 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA1P02647 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA1P02647 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA1P02647 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA1P02647 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA1P02647 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA1P02647 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA1P02647 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA1P02647 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA1P02647 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA1P02647 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOA1P02647 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA1P02647 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA1P02647 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA1P02647 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA1P02647 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA1P02647 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA1P02647 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA1P02647 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA1P02647 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA1P02647 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA1P02647 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA1P02647 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA1P02647 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA1P02647 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA1P02647 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA1P02647 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA1P02647 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA1P02647 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA1P02647 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA1P02647 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA1P02647 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA1P02647 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA1P02647 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA1P02647 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA1P02647 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA1P02647 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOA1P02647 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms