Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC24BO95487 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms