Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTDNEP1O95476 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDNEP1O95476 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms