Protein–RNA interactions for Protein: O94805

ACTL6B, Actin-like protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6BO94805 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTL6BO94805 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms