Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN5O75503 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN5O75503 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN5O75503 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN5O75503 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN5O75503 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN5O75503 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN5O75503 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN5O75503 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN5O75503 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN5O75503 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN5O75503 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN5O75503 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN5O75503 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN5O75503 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN5O75503 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN5O75503 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN5O75503 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN5O75503 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN5O75503 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN5O75503 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN5O75503 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN5O75503 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN5O75503 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN5O75503 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN5O75503 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN5O75503 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN5O75503 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN5O75503 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN5O75503 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN5O75503 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN5O75503 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN5O75503 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN5O75503 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN5O75503 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN5O75503 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN5O75503 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN5O75503 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN5O75503 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN5O75503 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN5O75503 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms