Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F6O75461 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F6O75461 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F6O75461 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F6O75461 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F6O75461 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F6O75461 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F6O75461 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F6O75461 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F6O75461 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F6O75461 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F6O75461 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F6O75461 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F6O75461 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F6O75461 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F6O75461 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F6O75461 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F6O75461 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F6O75461 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F6O75461 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F6O75461 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F6O75461 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F6O75461 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F6O75461 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F6O75461 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F6O75461 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F6O75461 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F6O75461 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F6O75461 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F6O75461 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F6O75461 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F6O75461 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F6O75461 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F6O75461 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F6O75461 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F6O75461 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F6O75461 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F6O75461 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F6O75461 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F6O75461 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F6O75461 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F6O75461 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F6O75461 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F6O75461 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F6O75461 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F6O75461 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F6O75461 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F6O75461 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms