Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms