Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG13O75143 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG13O75143 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG13O75143 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG13O75143 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG13O75143 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG13O75143 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG13O75143 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG13O75143 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG13O75143 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG13O75143 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG13O75143 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG13O75143 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG13O75143 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG13O75143 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG13O75143 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG13O75143 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG13O75143 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG13O75143 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG13O75143 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG13O75143 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG13O75143 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG13O75143 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG13O75143 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG13O75143 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG13O75143 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG13O75143 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG13O75143 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG13O75143 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG13O75143 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG13O75143 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG13O75143 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG13O75143 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG13O75143 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG13O75143 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG13O75143 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG13O75143 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG13O75143 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG13O75143 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG13O75143 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG13O75143 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG13O75143 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG13O75143 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG13O75143 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG13O75143 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG13O75143 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG13O75143 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG13O75143 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG13O75143 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG13O75143 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG13O75143 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG13O75143 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG13O75143 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG13O75143 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG13O75143 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG13O75143 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG13O75143 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG13O75143 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG13O75143 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG13O75143 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG13O75143 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG13O75143 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG13O75143 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG13O75143 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG13O75143 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG13O75143 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG13O75143 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG13O75143 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG13O75143 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG13O75143 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG13O75143 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG13O75143 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG13O75143 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG13O75143 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG13O75143 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG13O75143 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG13O75143 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG13O75143 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG13O75143 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG13O75143 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG13O75143 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG13O75143 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG13O75143 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG13O75143 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG13O75143 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG13O75143 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG13O75143 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG13O75143 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG13O75143 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG13O75143 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG13O75143 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG13O75143 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG13O75143 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG13O75143 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG13O75143 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG13O75143 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG13O75143 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG13O75143 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG13O75143 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG13O75143 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms