Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MCM3APO60318 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3APO60318 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms