Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRC1O43663 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRC1O43663 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRC1O43663 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRC1O43663 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRC1O43663 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRC1O43663 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRC1O43663 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRC1O43663 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRC1O43663 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRC1O43663 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRC1O43663 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRC1O43663 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRC1O43663 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRC1O43663 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRC1O43663 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRC1O43663 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRC1O43663 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRC1O43663 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRC1O43663 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRC1O43663 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRC1O43663 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRC1O43663 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRC1O43663 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRC1O43663 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRC1O43663 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRC1O43663 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRC1O43663 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRC1O43663 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRC1O43663 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRC1O43663 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRC1O43663 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRC1O43663 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRC1O43663 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRC1O43663 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRC1O43663 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRC1O43663 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRC1O43663 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRC1O43663 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRC1O43663 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRC1O43663 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRC1O43663 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRC1O43663 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRC1O43663 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRC1O43663 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRC1O43663 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRC1O43663 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRC1O43663 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRC1O43663 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRC1O43663 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRC1O43663 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRC1O43663 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRC1O43663 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRC1O43663 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRC1O43663 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRC1O43663 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRC1O43663 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRC1O43663 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRC1O43663 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRC1O43663 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRC1O43663 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRC1O43663 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRC1O43663 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRC1O43663 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRC1O43663 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRC1O43663 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRC1O43663 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRC1O43663 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRC1O43663 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRC1O43663 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRC1O43663 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRC1O43663 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRC1O43663 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRC1O43663 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRC1O43663 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRC1O43663 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRC1O43663 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRC1O43663 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRC1O43663 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRC1O43663 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRC1O43663 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRC1O43663 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRC1O43663 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRC1O43663 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRC1O43663 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRC1O43663 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRC1O43663 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRC1O43663 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRC1O43663 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRC1O43663 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRC1O43663 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRC1O43663 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRC1O43663 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRC1O43663 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRC1O43663 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRC1O43663 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRC1O43663 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRC1O43663 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRC1O43663 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRC1O43663 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms