Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APAF1O14727 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APAF1O14727 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APAF1O14727 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APAF1O14727 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APAF1O14727 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APAF1O14727 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APAF1O14727 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APAF1O14727 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APAF1O14727 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APAF1O14727 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APAF1O14727 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APAF1O14727 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APAF1O14727 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APAF1O14727 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APAF1O14727 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APAF1O14727 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
APAF1O14727 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APAF1O14727 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APAF1O14727 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APAF1O14727 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APAF1O14727 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APAF1O14727 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APAF1O14727 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APAF1O14727 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APAF1O14727 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APAF1O14727 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
APAF1O14727 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
APAF1O14727 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APAF1O14727 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APAF1O14727 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APAF1O14727 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APAF1O14727 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APAF1O14727 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APAF1O14727 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APAF1O14727 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APAF1O14727 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APAF1O14727 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APAF1O14727 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APAF1O14727 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APAF1O14727 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
APAF1O14727 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APAF1O14727 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APAF1O14727 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
APAF1O14727 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APAF1O14727 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
APAF1O14727 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
APAF1O14727 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APAF1O14727 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APAF1O14727 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APAF1O14727 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APAF1O14727 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APAF1O14727 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APAF1O14727 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APAF1O14727 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APAF1O14727 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APAF1O14727 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APAF1O14727 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APAF1O14727 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APAF1O14727 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APAF1O14727 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APAF1O14727 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APAF1O14727 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APAF1O14727 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APAF1O14727 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APAF1O14727 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APAF1O14727 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APAF1O14727 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APAF1O14727 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APAF1O14727 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APAF1O14727 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APAF1O14727 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APAF1O14727 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APAF1O14727 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APAF1O14727 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APAF1O14727 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APAF1O14727 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APAF1O14727 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APAF1O14727 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APAF1O14727 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APAF1O14727 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
APAF1O14727 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APAF1O14727 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APAF1O14727 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APAF1O14727 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APAF1O14727 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APAF1O14727 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APAF1O14727 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APAF1O14727 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APAF1O14727 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APAF1O14727 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APAF1O14727 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APAF1O14727 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APAF1O14727 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APAF1O14727 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APAF1O14727 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APAF1O14727 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APAF1O14727 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APAF1O14727 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APAF1O14727 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms