Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3KR12 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3KR12 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3KR12 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3KR12 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3KR12 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3KR12 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
J3KR12 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3KR12 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3KR12 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3KR12 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3KR12 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3KR12 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3KR12 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3KR12 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
J3KR12 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3KR12 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3KR12 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3KR12 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
J3KR12 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3KR12 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3KR12 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3KR12 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3KR12 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3KR12 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3KR12 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3KR12 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
J3KR12 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3KR12 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
J3KR12 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3KR12 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3KR12 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3KR12 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3KR12 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3KR12 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3KR12 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3KR12 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3KR12 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3KR12 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3KR12 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3KR12 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3KR12 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3KR12 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3KR12 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3KR12 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3KR12 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3KR12 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3KR12 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3KR12 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3KR12 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3KR12 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3KR12 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3KR12 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3KR12 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
J3KR12 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3KR12 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3KR12 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3KR12 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3KR12 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3KR12 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3KR12 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3KR12 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3KR12 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3KR12 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3KR12 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3KR12 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3KR12 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3KR12 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3KR12 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3KR12 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3KR12 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3KR12 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3KR12 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3KR12 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
J3KR12 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3KR12 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3KR12 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3KR12 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3KR12 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3KR12 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3KR12 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3KR12 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3KR12 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3KR12 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3KR12 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3KR12 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3KR12 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3KR12 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3KR12 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3KR12 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3KR12 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KR12 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KR12 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KR12 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KR12 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KR12 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KR12 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KR12 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KR12 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KR12 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms