Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms